En utilisant des couches pendant que vous modifiez les images que vous donne la possibilité de peindre sur ou sous l'image sans perdre l'image originale. Si vous décidez que vous ne voulez pas un changement, il suffit de supprimer la couche et l'image originale est rétablie. Vous pouvez utiliser l'outil Calques dans GIMP pour ajouter des couches à une image et modifier leur positionnement à volonté. Pour ajouter une nouvelle couche de fond, il suffit d'ajouter une couche à une image et de modifier sa position pour le placer en dessous de l'image originale sur l'empilement de couches.