Les effets secondaires de chondroïtine, tandis que signalé, sont rares. Certains des signes à rechercher comprennent la sensibilité à la lumière, perte de cheveux, des difficultés à respirer, de l'urticaire ou éruptions cutanées, serrement dans la gorge ou de la poitrine, des douleurs thoraciques, des douleurs d'estomac, des nausées, de la constipation et la diarrhée. Il ya aussi un possible risque accru de saignement. Un sens inconnue d'euphorie indique la nécessité de réduire l'utilisation de chondroïtine ainsi.