Comme avec la plupart des stéroïdes, l'acné est un effet secondaire fréquent, et peut soit être tolérée ou traitée avec une variété de médicaments anti-acné. Si l'utilisateur dispose d'une prédisposition à la calvitie masculine, stanazol peut aggraver plus que d'autres stéroïdes. Si l'utilisateur n'a pas fini de grandir, en utilisant stanazol peut entraîner le corps à cessé de croître, ce qui entraîne un retard de croissance.
Tout en prenant stanazol, la plupart des gens se plaignent généralement de douleurs articulaires, secs, qui se produisent en raison d'un manque de rétention d'eau inhérent à stanazol. Pour cette raison, les culturistes combinent souvent son utilisation avec d'autres stéroïdes base de testostérone.