Bien que la plupart des gens tolèrent chardon avec peu de plaintes graves, les personnes qui sont allergiques aux chardons, des plantes de l'aster, marguerites, ou les artichauts peuvent avoir une réaction allergique à chardon. Les effets secondaires possibles comprennent les nausées, brûlures d'estomac, de la diarrhée, de la faiblesse et de l'effondrement. Le chardon-Marie abaisse le taux de sucre dans le sang, et doit être utilisé avec prudence par les patients avec l'hypoglycémie et diabète.