Les femmes peuvent prévenir l'infection en gardant zones génitales propre et sèche, d'uriner après un rapport sexuel et d'éviter trop de bains moussants et la tenue de l'urine pendant de longues périodes. Après la miction, les femmes devraient essuyer de l'avant vers l'arrière. Ils devraient essuyer d'avant en arrière après un mouvement de l'intestin pour empêcher la propagation des germes de la zone rectale.
Bien que moins fréquent chez les hommes, ils peuvent prévenir l'infection en gardant le prépuce du pénis propre et utilisant latex ou en polyuréthane préservatifs pendant les rapports sexuels.