Génération chèques par l'intermédiaire du système de paie est un processus relativement simple. Certaines entreprises ont des chèques en blanc qui comprennent la signature autorisée. Traitement dépôt direct nécessite plus de pas que les chèques. Un fichier de dépôt direct doit être créé et envoyé à la banque. La personne de la paie doit vérifier avec la banque pour assurer le fichier est correctement reçu.
Si les dysfonctionnements de l'imprimante ou l'encre est faible, les retards peuvent survenir lors de l'impression des chèques. Ce problème est éliminé avec le dépôt direct. Les employés sont plus tolérants du mal imprimés talons de dépôts directs que d'un chèque illisible. En outre, les employés sont plus disposés à attendre sur leur talon de dépôt direct de paye que pour leurs chèques de paie.
Il est plus de temps pour concilier les contrôles que le dépôt direct. Le relevé de compte pour les contrôles répertorie chaque chèque individuel, qui doit être conciliée individuellement. La déclaration de dépôt direct comprend la somme totale, et une ventilation de chaque transaction.