La Yamaha FZS Waverunner, comme la plupart des bateaux, devrait aller dans le stockage au cours de la saison d'hiver. Avant de commettre l'Waverunner à sa maison d'hiver, cependant, il doit être préparé pour "stockage prolongé», comme il est mentionné dans le manuel d'entretien Yamaha. Hivernage la FZS a des parallèles à l'hivernage de tout autre bateau, mais le processus est beaucoup moins compliqué.