Le niveau de pH du sol régit un grand nombre de facteurs, tels que la disponibilité des nutriments, de carbone et des oligo-éléments essentiels, et a donc un grand impact sur la croissance bactérienne. Par conséquent, même des changements mineurs dans le pH du sol peuvent affecter considérablement la diversité des bactéries du sol. Par exemple, l'ajout de chaux ou de la cendre aux sols acides peut augmenter le pH du sol et de réduire son acidité. Par conséquent, le sol devient neutre ou légèrement alcaline, et soutient ainsi mieux la croissance bactérienne et la diversité. Cependant, ajouter trop de chaux ou de la cendre aux sols acides peut pousser le pH à des niveaux extrêmement alcalines du sol.
Selon une étude menée à Rothamsted Research au Royaume-Uni, lorsque le pH du sol est passé de 4 à 8, il entraîne une augmentation correspondante de la croissance bactérienne par quatre fois, mais toute augmentation supplémentaire des valeurs de pH peut être préjudiciable à bactérienne croissance. La croissance bactérienne est le plus prononcé à un pH de 7. L'augmentation du pH à des niveaux plus alcalines ou en diminuant le pH à des niveaux extrêmement acides peuvent être létale pour les populations bactériennes du sol.