Depuis la découverte de micro-organismes, il ya quelques siècles, les scientifiques ont été la recherche de meilleures façons d'identifier les bactéries. Certaines méthodes sont vieux et testées avec le temps, tandis que certaines méthodes sont nouvelles et d'origine génétique. De toute façon, un flux de travail très spécifique est nécessaire pour identifier les bactéries.