Selon un article publié dans le Journal of Perinatal Education par Kristen Montgomery, Ph.D., RN et professeur adjoint au Collège des sciences infirmières de l'Université de Caroline du Sud, la protéine de soja "est souvent utilisé pour remplacer les protéines animales dans le régime alimentaire d'un individu. Le soja est une légumineuse qui ne contient pas de cholestérol et est faible en gras saturés." Alors que les bienfaits du soya sont bien établies, certaines études récentes ont indiqué préoccupations possibles eu égard au développement du foetus. Plus précisément, la consommation de soja peut être lié à la reproduction des effets néfastes chez les fœtus de sexe féminin et les différences de développement possibles chez les enfants.
L'ensemble du processus de fabrication d'une poudre de protéine de soja, autrement connu sous le nom de protéines de soja (SPI), est également douteuse. Selon un article de Sally Fallon et nutritionniste Mary G. Enig, Ph.D., membres du Conseil national de la nutrition scientifiques, SPI est produite dans les usines "où une bouillie de graines de soja est d'abord mélangé avec une solution alcaline pour éliminer les fibres, puis précipité et séparé au moyen d'un lavage à l'acide et, enfin, on le neutralise dans une solution alcaline. Lavage à l'acide dans des cuves en aluminium lixivié des niveaux élevés d'aluminium dans le produit final. Le caillé résultants sont séchés par pulvérisation à haute température pour produire une poudre riche en protéines."